Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HTR1BP28222 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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