Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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