Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms