Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms