Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms