Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms