Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Usp18Q9WTV6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp18Q9WTV6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp18Q9WTV6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp18Q9WTV6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms