Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms