Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms