Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms