Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms