Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp2Q9JLK4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp2Q9JLK4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms