Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms