Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Tgm1Q9JLF6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm1Q9JLF6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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