Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms