Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift43Q9DA69 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms