Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms