Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931423N10RikQ9D4J9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms