Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fndc8Q9D2H8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fndc8Q9D2H8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fndc8Q9D2H8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fndc8Q9D2H8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fndc8Q9D2H8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc8Q9D2H8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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