Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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