Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms