Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms