Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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