Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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