Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnpo2Q99LG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms