Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms