Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms