Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GatbQ99JT1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms