Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms