Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms