Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc80Q8R2G6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms