Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms