Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot3Q8K0V4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms