Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a3Q8K0H7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms