Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnma3Q8JZW8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma3Q8JZW8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms