Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Znf628Q8CJ78 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf628Q8CJ78 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Znf628Q8CJ78 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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