Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms