Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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