Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot2Q8C5L3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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