Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms