Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn17Q8BXA6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn17Q8BXA6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms