Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap4Q8BMK4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap4Q8BMK4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap4Q8BMK4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap4Q8BMK4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap4Q8BMK4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap4Q8BMK4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap4Q8BMK4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms