Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms