Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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