Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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