Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms