Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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