Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms