Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx6Q6P8X1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms