Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg9bQ6EBV9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms